叫真 | 北京本轮彭斯批NBA对中国"卑躬屈膝" 巴克利:闭上你的疫情中的新冠病毒有突变,这个突变是怎样回事?

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摘要

较真要点:1从中国疾控中心公布的病毒基因序列来看,此次北京新发地检出的新冠病毒更接近欧洲流行的病毒株,意味着这次的新冠病毒极有可能是从欧洲,或者从被欧洲分支相应

叫真要点:

    1从中国疾控中心公布的病毒基因序列来看,此次北京新发地检出的新冠病毒更接近欧洲流行的病毒株,意味着这次的新冠病毒极有多是从欧洲,或从被欧洲分支相应病毒所感染的区域输入。
    2北京新发现的病毒株属于强沾染性病毒株,检出的病毒带有此前研究发现的 D614G突变。有研究指出,变异后的病毒之所以能获得传播上的优势,是由于变异产生在新冠病毒的S蛋白区域,S蛋白区域的变异可能致使病毒更容易和细胞产生融会,从而增强其沾染性。
    3有研究发现,经D614G突变后的病毒株感染细胞能力明显提高,研究结果显示感染效力提高了9倍以上。但这是仅使用病毒的S蛋白感染细胞得出的结论,在现实中具体情况如何,还需要有流行病学证据支持,其实不意味着实际生活中其感染力就可以到达这个量级。

    查证者:李雷丨中国科学院生物学博士

    叫真 | 北京本轮彭斯批NBA对中国"卑躬屈膝" 巴克利:闭上你的疫情中的新冠病毒有突变,这个突变是怎样回事?

    1、此次北京发现的新冠病毒在进化上更接近欧洲流行病毒株

    6月18日,中国疾控中心发布了2020年6月北京新发地新冠疫情及病毒基因组序列数据,包括北京市确诊病例基因组序列数据(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02)和环境样本基因组序列数据(NMDC60013903-03)。

    从此次公布的病毒基因序列来看,3支病毒株在进化关系上属于同1进化枝,这意味着这3支病毒株应当是同1来源。

    叫真 | 北京本轮彭斯批NBA对中国"卑躬屈膝" 巴克利:闭上你的疫情中的新冠病毒有突变,这个突变是怎样回事?北京上传的3组新冠病毒序列提示这3者属于同1进化枝,图片来源于nextstrain

    而这3者,从序列类似性上看和欧洲流行的病毒株更类似。下图是基于病毒基因变异绘制的进化树,红圈标注的是此次北京新冠病毒的序列,可以看出,红圈处整体上属于流行于欧洲地区的病毒株(黄绿色表示欧洲分支),而非年初流行于全国范围的亚洲病毒进化分支(蓝色表示亚洲分支)。这提示我们,此次的新冠病毒极有多是从欧洲,或被欧洲分支相应病毒所感染的区域输入。

    叫真 | 北京本轮彭斯批NBA对中国"卑躬屈膝" 巴克利:闭上你的疫情中的新冠病毒有突变,这个突变是怎样回事?重新冠病毒演变树可以看出北京此次爆发新冠序列整体上和欧洲分支更加接近,图片来源于nextstrain

    2、北京新发现的病毒株属于强沾染性病毒株

    最使人担心的是,此次北京检测出的病毒株序列,均带有前期研究发现的病毒突变——“D614G”突变。所谓D614G突变指新冠病毒氨基酸序列的第614位由原来的天冬氨酸(Asparagine,缩写为D)变成了甘氨酸(Glycine,缩写为G),病毒株也从D614变成G614。

    下图是北京此次上传的新冠病毒序列变异信息,红框圏出的地方就是D614G突变。

    叫真 | 北京本轮彭斯批NBA对中国"卑躬屈膝" 巴克利:闭上你的疫情中的新冠病毒有突变,这个突变是怎样回事?北京上传的此次新冠序列中的变异1天以后的11月9日晚,CBA公司开出了对肯帝亚俱乐部及史琳杰本人的罚单,处罚的缘由则是公然评论裁判员的判罚。而肯帝亚方面则回应表示,史琳杰与CBA公司对争议判罚的沟通,是在相对封闭的环境中进行的,被偷拍和发布均是他人行动,因此俱乐部仍将提出申述。,红框标示为D614G,图片来源于国家微生物科学数据中心

    其实在3月之前,全球流行的病毒株主要是D614,但是从3月起,新的突变株G614开始快速增加,并且迅速成了占世界主流的病毒株,到了4月,全球的主要流行病毒株1半以上是G614。

    D614为何具有强沾染性?美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory)的1篇研究此前就对此进行了分析。研究发现,D614G变异产生在新冠病毒的S蛋白区域。S蛋白就是大家看到新冠病毒表面那些突出的地方,也是新冠病毒命名中的“冠”的来源。S蛋白可以和我们细胞上的ACE2受体进行结合,使得我们的细胞将其当作正常物资吞入,从而产生感染,S蛋白对新冠病毒来讲就是1把开启细胞的钥匙。而这个D614G变异,恰好使得S蛋白结构产生了1些变化,下降了这个蛋白的两个亚基之间的作用力,作者认为这类改变可能有两种影响:

    1、使病毒更容易和细胞产生融会,从而使沾染性增强。

    冬季铁人3项由跑步、山地自行车和越野滑雪 3 项构成,对每一个单项的长度虽然有范围要求,但并未规定具体长度。此次比赛将在太阳岛风景区举行,依照国际铁联的要求,组委会终究肯定了 7.22 千米跑步、12 千米山地自行车、10.6 千米越野滑雪,全程 29.82 千米的赛程。

    2、增加ADE效应。所谓ADE效应,是指“抗体依赖增强症”(antibody-dependent enhancement)。1般情况下,我们感染了病原体后会取得特异性免疫,且生成记忆细胞,这样下次感染的时候免疫就会迅速激活从而发挥作用。但是有的时候,这类特异性免疫反应是有害的,那就是如果病原体产生了变异再次入侵,机体没有辨别清楚,继续产生之前的免疫,这类免疫对变异后的病原体是无效或有限的。机体不再去应对新病原体,反而会帮助其侵上陣成疑:/入宿主细胞。结果就是感染后的人,会比没有抗体的人症状更严重。结合SARS病毒的研究,作者推测这类变异可能会致使ADE效应增加(此处仅为作者的推测,目前新冠肺炎是不是存在ADE效应还没有完全肯定)。

    3、在多个研究中D614G变异使病毒的感染能力变强,但不代表实际场景中也能到达如此高的感染能力

    来自佛罗里达州斯克里普研究院(Scripps Research Institute)的研究人员用新冠病毒关键蛋白S蛋白构建了D614和G614的伪病毒并用来感染人肾上皮细胞系293T,然后检测感染后细胞中的荧光变化,发现变异后的G614感染细胞能力明显提高,要高出D6141个数量级——感染效力提高9倍以上。

    “9倍”听起来使人不寒而栗,但需要注意的是,这个是使用病毒的S蛋白感染细胞得出的结论,在现实中具体情况如何,还需要有流行病学证据支持,其实不意味着实际生活中其感染力能到达9倍这么高,以下提到的研究也是一样的道理。

    来自纽约基因组研究中心Neville E. Sanjana团队采取类似的策略构建了包括G614在内的新冠S蛋白伪病毒,然后用其来感染3种人体细胞,分别是肺细胞(A549)、肝脏细胞(Huh7.5)和结肠细胞(Caco⑵),然后用流失细胞计数来检测感染后的荧光强度。

    叫真 | 北京本轮彭斯批NBA对中国"卑躬屈膝" 巴克利:闭上你的疫情中的新冠病毒有突变,这个突变是怎样回事?新冠病毒伪病毒感染3种细胞的实验进程,图源自论文

    结果发现D614G变异在3种细胞系中均提高了伪病毒感染细胞的能力,提升比例到达2.4⑺.7倍,在肝脏细胞中,这类变异后感染能力提升最为明显。

    虽然北京新产生疫情中的病毒株均有携带D614G突变,但要知道这个突变其实不是在此次北京疫情中才产生,突变株也不是仅在北京出现——6月之前,该类型的突变株就已是世界主流的病毒株了。至于变异后的病毒株感染力究竟较变异前强了多少,实验室研究的数据其实不能作中国队和韩国队的比赛历来都不需要动员,哪怕是双方都不是全主力,但比赛的看点照旧是很多的。国足这边多位大将因伤不能出战,整体的实力、场地等都处于下风,但是也希望国足的将士们可以披上国家队战袍以后全力以赴,争取打出自己的精气神。为肯定的结论,所以无需恐慌,相信严格的防控是可以将其控制住的。

    本文编辑:ambergchen

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